В 60-е годы XX века в НИИ автоматической аппаратуры Минрадиопрома СССР было организовано второе комплексное отделение. Его главной задачей стало общее руководство разработкой и внедрением АСУ противовоздушной обороны Ленинграда «С-100» (АСУ-100В). Полученный опыт впоследствии использовался отделением при автоматизации оперативного звена управления войск ПВО и создании системы «Алмаз», некоторые элементы которой эксплуатировались в нашей стране практически до начала 2000-х.
23 ноября 1972 года второе комплексное отделение НИИ АА было переведено на самостоятельный баланс и позднее переименовано в НИИ «Восход».
За 46 лет НИИ «Восход» прошел путь от разработчика систем специального назначения до крупнейшего поставщика ИТ для органов государственной власти, среди которых Министерство цифрового развития, связи и массовых коммуникаций, Федеральный центр информатизации при Центральной избирательной комиссии, Генеральная прокуратура, Министерство внутренних дел, МЧС, Министерство обороны, Министерство иностранных дел, Федеральная Миграционная Служба, Министерство транспорта и Министерство здравоохранения Российской Федерации.
Сегодня НИИ «Восход» участвует в реализации сложных и комплексных проектов в рамках перехода России к цифровой экономике и цифровой трансформации органов государственного управления. Это общая заслуга как нынешнего коллектива, так и тех, кто стоял у истоков создания и развития Института.